一、办公室

负责文电、信息、档案、保密等工作；负责文字综合工作；负责后勤管理工作；负责财务管理、资产管理、政府采购、财务审计等工作。

人员编制6名，主任1名。

二、党群工作部

负责党的组织建设、党风廉政建设、宣传教育、思想工作、意识形态、精神文明建设、统战等党务工作；负责纪检监察工作；负责工会、共青团、妇联等群团工作；负责机构编制、人事管理和离退休干部等工作。

三、疫病防控部

负责重大动物疫病流行病学调查和动物样品采集工作；组织实施动物疫病的预防、控制；参与重大动物疫病的扑灭和技术仲裁；负责动物疫病防治技术、免疫技术指导；负责国家规定强制免疫病种及其它动物疫病预防兽用生物制品的组织供应等工作。

人员编制10名，部长1名

四、疫病检验部

负责实施动物疫病的监测、检测、实验室诊断；负责动物疫病的诊断定性；负责重大动物疫病免疫效果评估；负责实验室生物安全管理。

人员编制10名，部长1名

五、动物疫情预警部

负责重大动物疫情预警预报；负责搜集动物疫病信息、技术查新；负责兽医实验室质量体系和生物安全体系管理；负责业务人员的培训考核与业务指导。

人员编制5名，部长1名

六、狂犬病综合防控部

负责狂犬病强制免疫方案制定；负责狂犬病疫苗供应和免疫工作的组织实施；负责外运犬猫的疫病检测；负责犬留置管理工作。

人员编制5名，部长1名

七、兽药饲料检验部

负责对兽药、饲料质量和畜产品有害物质残留进行检验并出具检验报告；为拟定畜禽产品有害物质残留监控计划和应急预案提供科学依据；负责畜牧良种繁育体系建设等工作。

人员编制9名，部长1名

八、植物及水产品检验监测部

负责农作物种业、病虫害预测预报及植保新技术试验、示范和推广工作；负责水生动植物疫病疫情监测、预报和处置等工作。

人员编制10名，部长1名

九、动物无害化处理场

负责动物尸体储存和无害化处理；负责出入场车辆和场区消毒；负责设备的维修维护等工作。

人员编制5名，部长1名